軟件功能是酶標儀所具有的對ELISA定性和定量測定及其他測定方式如酶動力學、紫外、凝集等的統計分析并報告結果的功能，是判斷酶標儀質量的一個指標。ELISA 測定，酶標儀需具有陽性判斷值(Cutoff)及測定灰區的統計計算功能，如血站實驗室篩選獻血員進行抗 - HCV、HBSAG、抗 - HIV 測定時，常遇到測定吸光度處于Cutoff 附近，但又低于Cutoff 的樣品，這樣的血輸給患者導致輸血后傳染疾病的可能性增大。若設定灰區，以灰區下限作為判斷標準，可減少輸血后傳染疾病的可能性。此外四參數測定的劑量反應曲線適合于定量酶免疫測定曲線的擬合。因此，如果目的為定量測定，要有這種曲線回歸方程計算分析功能。其他如連點、直線等回歸計算，可根據酶標儀的應用目的而定。

丙氨酸氨基轉移酶(ALT)的測定，是對獻血者*的篩查項目之一。方法上有速率法和賴氏法等。若采用賴氏試管法，費工、費時，不但從方法上得不到統一，而且不利于計算機對原始數據的網絡化管理。若采用微板酶標儀定量(U/L)方法，利用酶標儀與計算機接口，聯接血站局域網絡，這就同其他酶法檢測項目一樣，實現了實驗室原始數據的計算機管理。

采用試管法檢測Rh血型，操作繁鎖，肉眼判讀結果缺乏客觀性。故將平底微板法與酶標儀掃描，電腦自動判讀打印技術相結合，用TCEAN全自動加樣分析系統完成。經常規13032份標本的檢測，符合率達*。利用酶標儀法檢測Rh血型具有較好的重復性、準確性，操作簡便快速、判讀結果客觀可靠，也易于原始結果的保存，提高自動化程度，能的篩選獻血者，有利于實驗室的標準化管理，也有利于血站稀有血型庫的建立。